Согласно опубликованным дополнительным документам и записям GenBank, связанным со статьей, опубликованной в 2020 году в журнале New England Journal of Medicine (NEJM) , геном хантавируса был создан из «человеческой крови» в американской военной биолаборатории Форт-Детрик.
Геномная последовательность хантавируса Анд была собрана в печально известном центре из фрагментированных последовательностей, полученных из человеческой крови, с использованием программного обеспечения для компьютерной сборки и заполнения референсного генома.
Издание Modernity.news сообщает: В документах о финансировании указано, что работа по реконструкции генома хантавируса в Форт-Детрике финансировалась за счет средств, выделяемых правительством США на борьбу с биозащитой и инфекционными заболеваниями, связанных с HHS/NIAID ( HHSN272201800013C и HHSN272200700016I ), включая контракты с Battelle Memorial Institute и Laulima Government Solutions.
ОБОЙТИ ЦЕНЗУРУ
Подпишитесь, чтобы получать нефильтрованные новости прямо на вашу электронную почту.
Вы можете отписаться в любое время. Подписываясь, вы соглашаетесь с нашими Условиями использования.
Общий потенциальный объем финансирования, выделенный на два контракта между Форт-Детриком и NIAID, составляет приблизительно 387,5 миллионов долларов.
Агент Моссада на смертном одре признался: «Израиль убил Джона Леннона».
Согласно документам, ученые из Института медицинских исследований инфекционных заболеваний армии США (USAMRIID) якобы получили образцы крови от предполагаемых больных хантавирусом и использовали эти образцы для создания последовательности генома, которая сейчас хранится в GenBank и цитируется в научной литературе.
Та же самая последовательность генома хантавируса Andes, созданная в Форт-Детрике, в настоящее время используется исследователями в качестве эталонного генома для анализа и сравнения последовательностей, связанных с недавней вспышкой хантавируса в 2026 году на борту круизного судна MV Hondius.
Эта взаимосвязь поднимает важные вопросы о том, не строятся ли современные системы обнаружения вспышек заболеваний, геномного надзора и авторитарного реагирования на пандемии все чаще на основе реконструированных с помощью компьютеров эталонных последовательностей, созданных в рамках военных и биозащитных исследовательских проектов, а не на основе непосредственно секвенированных очищенных вирусных изолятов.
Если основополагающие последовательности генома, лежащие в основе ПЦР-тестирования, отслеживания вспышек, карантинной политики, систем эпидемиологического надзора и разработки вакцин, сами по себе в значительной степени зависят от компьютерной реконструкции, статистического моделирования и заполнения референсных последовательностей, а не от прямого непрерывного секвенирования очищенных вирусных изолятов, это поднимает серьезные вопросы о том, не становится ли вся система реагирования на пандемию все более замкнутой и самореферентной.
Это делает систему потенциально пригодным для использования в качестве оружия, поскольку тот, кто контролирует эталонные последовательности, вычислительные конвейеры и диагностические стандарты, фактически контролирует основу, на которой выявляются, моделируются, объявляются вспышки заболеваний и реагируют на них.
В Форт-Детрик поступили образцы человеческой крови.
В дополнительном приложении к статье в NEJM прямо указано: «В геномный анализ были включены образцы цельной крови от 28 (82% из 34) лабораторно подтвержденных случаев хантавирусного легочного синдрома, вызванного вирусом ANDV в Эпуйене».
Исследователи также написали: «РНК была выделена из 400 мкл цельной крови…»
В приложении также говорится, что образцы были физически доставлены в военную систему биологической защиты Форт-Детрика: «Образцы были отправлены в USAMRIID в соответствии с соглашением о передаче материалов (контрольный номер MRMC: W81XWH-18-0469)…»
Это означает, что опубликованный геном хантавируса был получен из фрагментированных последовательностей РНК, извлеченных непосредственно из смешанных образцов человеческой крови, обработанных в рамках процесса биолаборатории американской армии.
Ученые утверждают, что перед построением генома они удалили человеческий генетический материал.
Согласно документам, ученые из Форт-Детрика не смогли напрямую секвенировать полный, непрерывный геном хантавируса из очищенных вирусных частиц.
Вместо этого рабочий процесс включал в себя:
- извлечение смешанного генетического материала из человеческой крови.
- удаление последовательностей человеческого ДНК с помощью вычислительных методов.
- сборка фрагментированных последовательностей ДНК в частичные фрагменты генома, называемые контигами.
- и заполнение недостающих геномных пробелов с использованием ранее опубликованных эталонных последовательностей из GenBank.
В приложении прямо указано: «Удаление прочтений из генома и транскриптома человека было впоследствии выполнено путем выравнивания прочитанных с учетом качества прочтений по эталонному геному человека GRCh38…»
Ученые из Форт-Детрика утверждают, что сначала отфильтровали человеческий генетический материал из данных секвенирования, полученных из крови, а затем собрали оставшиеся фрагменты в то, что впоследствии стало опубликованным геномом хантавируса Анд.
Однако, поскольку исходный материал состоял из смешанных фрагментов ДНК, полученных из человеческой крови, а не из непосредственно секвенированного очищенного вирусного изолята, окончательный опубликованный геном по-прежнему зависел от компьютерной интерпретации, решений по реконструкции и заполнения данных с помощью референсных последовательностей для определения того, что в конечном итоге считалось последовательностью «хантавируса».
Окончательный опубликованный геном не был просто «считан» непосредственно из очищенной вирусной частицы.
Это стало возможным благодаря многоуровневому компьютерному анализу, включающему фильтрацию, реконструкцию, статистическое определение консенсуса и сопоставление референсных последовательностей, выполненному в рамках биоинформатического конвейера Форт-Детрик.
Опубликованный геном был склеен с использованием эталонных последовательностей.
В приложении объясняется, как был собран геном: «Для создания консенсусных геномов ANDV очищенные риды были собраны de novo с использованием SPAdes…»
Однако данные секвенирования не позволили получить полные, непрерывные геномы непосредственно из образцов крови пациентов.
Вместо этого исследователи признали, что недостающие участки генома пришлось заполнить, используя ранее опубликованные последовательности генома: «Пробелы и концы неполных контигов были заполнены последовательностями из близких полных геномных сегментов из GenBank…»
Это означает, что фрагменты окончательно опубликованного генома хантавируса были объединены с использованием более старых эталонных последовательностей генома, где данные прямого секвенирования отсутствовали или были неполными.
В приложении также указано: «Для определения консенсусной последовательности использовались только основания с показателем качества Phred >Q20 и минимальным 3-кратным покрытием».
Определение консенсусной последовательности — это компьютерный процесс, который генерирует «наилучшую» последовательность генома из фрагментированных данных секвенирования после фильтрации, выравнивания и реконструкции.
Если в опубликованном геноме хантавируса отсутствовали некоторые фрагменты, которые пришлось восполнять с помощью более старых эталонных последовательностей, то какая часть окончательного генома была секвенирована непосредственно из крови пациента, а какая — с помощью компьютерной реконструкции?
Более половины некоторых сегментов генома отсутствовало.
Кроме того, данные свидетельствуют о том, что некоторые сборки генома были существенно неполными до реконструкции и заполнения референсных последовательностей.
В таблице S3 показано, что сегмент L был достигнут только у одного пациента: покрытие «3080/6562 [46,94%]».
Это означает, что более половины этого сегмента генома отсутствовало до того, как были использованы дополнительные методы реконструкции и заполнения данных с помощью референсного генома для завершения опубликованной последовательности.
В других образцах пациентов было достигнуто гораздо более высокое покрытие, во многих случаях приближающееся к 99%, но в приложении подтверждается, что неполные контиги и отсутствующие геномные регионы были повторяющейся частью процесса сборки.
Это означает, что некоторые участки опубликованного генома хантавируса не были секвенированы непосредственно из материала пациентов, а были реконструированы с помощью компьютерных методов и объединены там, где отсутствовали исходные геномные данные.
Это вызывает серьезные вопросы о точности и надежности окончательно опубликованного генома, поскольку значительные участки некоторых последовательностей отсутствовали и впоследствии были реконструированы с помощью компьютерного заполнения эталонных фрагментов, а не путем прямого секвенирования материала пациента.
Праймеры для ПЦР также подходят для анализа генетического материала человека.
Значимость полученных результатов становится еще выше, если рассматривать их в контексте недавних анализов BLAST, показавших, что опубликованные ПЦР-праймеры для хантавируса и флуоресцентные зонды неоднократно совпадали с генетическим материалом человека.
Согласно анализу: «части генетических последовательностей, используемых в ПЦР-тесте для предполагаемого обнаружения хантавируса, также напрямую совпадают с последовательностями ДНК человека».
В отчете было зафиксировано следующее:
- 19 из 19 точных совпадений,
- 20/20 точных совпадений,
- 18/18 точных совпадений,
- и многочисленные 17 из 17 точных совпадений между компонентами ПЦР хантавируса и областями генома человека.
Сам флуоресцентный зонд для обнаружения — компонент, ответственный за генерацию «положительного» сигнала ПЦР — также неоднократно давал точные и почти точные совпадения с ДНК человека.
Полученные результаты приобретают особое значение в свете рабочего процесса в Форт-Детрике, который начинался с анализа смешанных образцов человеческой крови и требовал компьютерного вычитания человеческого генетического материала перед сборкой генома.
Совпадение геномов вызывает очевидные вопросы о том, насколько уверенно система ПЦР может отличать предполагаемый генетический материал хантавируса от генетического материала человека, если опубликованный эталонный геном был реконструирован на основе данных секвенирования образцов крови человека.
Документы DARPA раскрывают структуру Пентагона для создания вирусных последовательностей исключительно в цифровом формате.
Рабочий процесс реконструкции хантавируса в Форт-Детрике также соответствует ранее опубликованным документам DARPA, описывающим системы, поддерживаемые Пентагоном и предназначенные для работы даже в тех случаях, когда «доступна только электронная информация о последовательности вируса».
В документах DARPA описаны системы, предназначенные для:
- взять последовательности цифрового генома,
- синтезировать геномы инфекционных клонов,
- Размножать вирусы в клеточных системах,
- и быстро преобразовывать загруженные генетические последовательности в мРНК-противодействия.
Платформа предназначена для работы даже в отсутствие физического вируса, а только в наличии компьютерного файла.
В документах указано: «Поскольку мы понимаем, что во время пандемии может быть доступна только электронная информация о последовательности вируса…»
Запись в GenBank подтверждает происхождение генома хантавируса из крови человека.
Запись в GenBank, связанная со вспышкой заболевания, независимо подтверждает, что биологический исходный материал был использован для создания опубликованного генома.
В записи указано: /isolation_source=“цельная кровь”
В метаданных GenBank также указан конвейер компьютерной сборки, использованный для генерации генома:
- Рэй
- Bowtie2
- Пикар
- Prinseq-lite
- Cutadapt
- секвенирование Illumina
В приложении к журналу NEJM и записях GenBank не содержится информации о следующем:
- очистка интактных вирусных частиц,
- изоляция бляшек,
- Очистка вирусной культуры перед секвенированием,
- или путем прямого секвенирования очищенных вирионов.
Вместо этого, как показывают записи, опубликованный геном хантавируса Анд был собран в Форт-Детрике из фрагментированных последовательностей, полученных из человеческой крови, после того, как человеческий генетический материал был удален с помощью компьютерных методов, а недостающие геномные регионы были заполнены с использованием ранее опубликованных эталонных последовательностей генома.
Итог
Документы показывают, что система биологической защиты и реагирования на вспышки заболеваний все больше основывается на компьютерной реконструкции геномных последовательностей, полученных из фрагментированного смешанного биологического материала и дополненных конвейерами сборки, управляемыми эталонными последовательностями, а не на прямом непрерывном секвенировании очищенных вирусных частиц.
Затем эти собранные на компьютере консенсусные геномы становятся основой для:
- ПЦР-тестирование,
- филогенетическое моделирование,
- картирование трансмиссии,
- расчеты репродуктивного числа,
- отслеживание вспышек заболеваний,
- карантинные меры,
- системы наблюдения,
- а также разработка вакцин или мРНК-контрмер.
Иными словами, те же самые сгенерированные компьютером геномные конструкции, собранные с помощью алгоритмов фильтрации, заполнения референсных последовательностей и статистического моделирования консенсуса, впоследствии рассматриваются как авторитетная биологическая основа для всей инфраструктуры реагирования на вспышки заболеваний.
Теперь эта концепция используется для оправдания заявлений основных средств массовой информации и авторитарных карантинных мер, введенных правительствами в отношении пассажиров судна Hondius.
Комментариев нет:
Отправить комментарий